Ajankohtaista

Projektiasiantuntija/Tutkijatohtori, Lääketieteellinen bioinformatiikka

13.5.2021 | Avoimet työpaikat

https://duunitori.fi/tyopaikat/tyo/projektiasiantuntijatutkijatohtori-laaketieteellinen-bioinformatiikka-stsur-13186530?utm_source=loimu&utm_medium=site

Etsimme joukkoomme data-analytiikkaan ja bioinformatiikkaan perehtynyttä asiantuntijaa Turun Lääketieteellisen Bioinformatiikan keskukseen (MBC). Kehitämme laskennallisia data-analyysityökaluja ja tilasto- ja koneoppimismenetelmiä laajojen molekulaaristen ja kliinisten aineistojen tulkintaan lääketieteellisessä tutkimuksessa tiiviissä yhteistyössä lääketieteen tutkimusryhmien ja biopankkien kanssa. Ydinpalveluyksikkönä ja kansallisen Biokeskus Suomi bioinformatiikkainfrastruktuurin koordinaattorina tuemme lisäksi korkeatasoista tutkimusta tarjoamalla bioinformatiikkatukea muun muassa akateemisille tutkimusyksiköille ja terveydenhuollon yksiköille.

Asiantuntija työskentelee läheisessä yhteistyössä InFLAMES-lippulaivaan kuuluvien tutkijoiden kanssa immunologian ja bioinformatiikan aloilla. InFLAMES-lippulaiva on Turun yliopiston ja Åbo Akademin yhteinen hanke, jonka tavoitteena on olla kansainvälisesti tunnettu huipputason immunologisen tutkimuksen ja kehityksen keskus, joka on houkutteleva yhteistyökumppani sekä huippututkijoille että yrityksille: https://inflames.utu.fi/

Tarjoamme näköalapaikan nopeasti kehittyvällä lääketieteellisen bioinformatiikan alalla ja monipuoliset mahdollisuudet kehittyä alan asiantuntijana ja verkostoitua maailman johtavien asiantuntijoiden kanssa. Monikulttuurinen ja monitieteinen tiimimme tarjoaa työyhteisön, joka edistää luovuutta ja monimuotoisuutta. Tutustu tutkimusryhmäämme täällä: https://elolab.utu.fi

Keskeiset tehtävät

  • Yksisoludatan analysointiin liittyvien uusien työkalujen käyttöönotto, testaus ja kehitys (mukaan lukien transkriptomiikka, epigenomiikka ja proteomiikka)
  • Erilaisten sekvensointidatojen ja massasytometriadatojen prosessointi ja laskennallinen analyysi
  • Bioinformatiikan asiantuntijatuen tarjoaminen

Edellytykset

  • Kokemus erilaisista bioinformatiikan data-analyysityökaluista
  • Kokemus omiikkadatojen analysoinnista
  • Hyvät ohjelmointitaidot (esim. Python, R) sekä kyky työskennellä versionhallintatyökalujen kanssa (esim. Git)
  • Hyvät kommunikaatiotaidot englanniksi ja erinomaiset yhteistyötaidot
  • Akateeminen tutkinto soveltuvalta alalta

Eduksi katsotaan

  • Kokemus yksisolu- tai massasytometria-analytiikasta
  • Kokemus biolääketieteen tutkimustyöstä

Palkka

Palkka määräytyy suomalaisten yliopistojen työehtosopimusjärjestelmän mukaan. Tehtävä sijoittuu opetus- ja tutkimushenkilöstön tai muun henkilöstön henkilöstöryhmään ja palkka on keskimäärin 2300-3000 eur/kk maisterin tutkinnon omaavalle henkilölle ja 3100-3600 eur/kk tohtorin tutkinnon omaavalle henkilölle.

Sopimuksen kesto

Tehtävä alkaa 1.9.2021 tai sopimuksen mukaan. Tehtävä on määräaikainen kahdeksi vuodeksi, mutta on mahdollista, että tehtävä jatkuu pidempään. Tehtävässä on kuuden kuukauden koeaika.

Hakeminen

Hakemukset tulee jättää viimeistään 7.6.2021 yliopiston sähköisellä hakulomakkeella. Hakemukseen tulee liittää motivaatiokirje, ansioluettelo ja kahden suosittelijan yhteystiedot. Linkki sähköiseen hakemukseen löytyy osoitteesta www.utu.fi/careers.

Lisätietoja avoimesta tehtävästä antaa bioinformatics-coordinator(at)utu.fi or +358 (0)29 450 3796. Hakuprosessiin liittyen voit olla yhteydessä HR asiantuntija Paula Luomaan paula.luoma(at)utu.fi.

Tutkija, genotoksikologia

13.5.2021 | Avoimet työpaikat

https://duunitori.fi/tyopaikat/tyo/tutkija-stse-13186637?utm_source=loimu&utm_medium=site

Työterveyslaitos on työhyvinvoinnin asiantuntija, joka tutkii, palvelee ja vaikuttaa. Visiomme on ”Hyvinvointia työstä”, sillä terveellinen, turvallinen ja mielekäs työ luo hyvinvointia. Kehitämme asiakkaidemme kanssa hyviä työyhteisöjä ja turvallisia työympäristöjä sekä tuemme työntekijöiden työkykyä. Asiakkaitamme ovat työpaikat, päättäjät, kansalaiset, työterveysyksiköt sekä muut työhyvinvointia kehittävät organisaatiot. Toimipisteemme sijaitsevat Helsingissä, Kuopiossa, Oulussa, Tampereella ja Turussa. Työntekijöitä on noin 500. Lisätietoja: www.ttl.fi @tyoterveys

Työturvallisuus-yksikön genotoksikologian tutkimusryhmään haetaan

TUTKIJAA


määräaikaiseen työsuhteeseen tutkimaan mikro- ja nanomuovien ympäristölle altistumisen genotoksisia vaikutuksia in vitro, in vivo ja ihmisryhmissä. Tehtävä on osa EU:n H2020 PlasticHeal -tutkimushanketta, jonka kesto on kaksi vuotta. Tutkijana osallistut myös ryhmän muihin projekteihin.

Työssä suoritat kokeita ja analyyseja näytteistä ja tuloksista sekä kirjoitat raportteja ja tieteellisiä artikkeleita. Tehtäviisi kuuluu myös tukea projektien teknisessä koordinoinnissa ja toteuttamisessa, mukaan lukien osakokonaisuuksien johtaminen. Osallistut myös hankkeiden tulosten levittämiseen.

Olet etsimämme henkilö, mikäli sinulla on tehtävään soveltuva tohtorin tutkinto biologian, toksikologian tai siihen liittyvältä alueelta. Sinulla on asiantuntemusta in vivo- ja in vitro -malleissa geneettisen toksikologian alalla. Tehtävässä toimiminen vaatii hyvää englannin kielen kirjoitus- ja viestintätaitoa. Etuna pidetään aikaisempaa kokemusta virtaussytometrianalyyseistä, mikroskopiasta, in vitro syöpämenetelmistä ja ihmisen biomonitorointitutkimuksista.

Tehtävä on kokoaikainen ja määräaikainen työsuhde kahden vuoden ajaksi. Työ alkaa 15. elokuuta tai sopimuksen mukaan. Noudatamme työsuhteessa 6 kuukauden koeaikaa. Palkkaus ja työsuhteen ehdot määräytyvät Työterveyslaitoksen työehtosopimuksen mukaan. Työ sijoittuu Työterveyslaitoksen Helsingin toimipisteeseen.

Tarjoamme sinulle monipuolisen ja haasteellisen työn moniammatillisessa työyhteisössä sekä hyvät mahdollisuudet kehittää omaa osaamistasi. Henkilöstöetumme tukevat työhyvinvointiasi. Käytössäsi ovat laajat työaikaliukumat (klo 6-21) ja etätyömahdollisuus. Lisäksi tarjoamme muun muassa lounas-, kulttuuri-, liikunta- ja hierontaedun, laajan työterveyshuollon sekä mahdollisuuden käyttää työajasta tunti viikossa liikuntaan.

Kiinnostuitko? Jätä hakemuksesi TTL:n verkkosivujen kautta osoitteessa www.ttl.fi/rekry 31.5. mennessä. Lisätietoja tehtävästä antavat vanhempi tutkija Julia Catalán (julia.catalan@ttl.fi, 0503528521) ja johtaja Tommi Alanko (tommi.alanko@ttl.fi).

WWW-osoite http://www.ttl.fi
Yhteystiedot Lisätietoja tehtävästä antavat vanhempi tutkija Julia Cataln (julia.catalan@ttl.fi, 0503528521) ja johtaja Tommi Alanko (tommi.alanko@ttl.fi).
Työpaikan osoite 00250 HELSINKI
Työ alkaa 15.8. tai sopimuksen mukaan
Työaika kokoaikatyö
Työn kesto yli 12 kuukautta
Haku päättyy 31.05.2021 klo 23:59
Ilmoitus jätetty 10.05.2021
Ilmoitusnumero 10748871

Kuusi metabolomiikan tutkimustehtävää – teknikosta erikoistutkijaan

9.5.2021 | Avoimet työpaikat

https://www.utu.fi/fi/yliopisto/tule-meille-toihin/avoimet-tehtavat

Etsimme innovatiivisia hakijoita uusiin metabolomiikan tutkimustehtäviin:

  • 1-2 erikoistutkijaa/tutkijatohtoria
  • 1-2 tutkijatohtoria/väitöskirjatyöntekijää
  • 1-2 laboratorioinsinööriä/teknikkoa

Turun yliopisto vahvistaa metabolomiikan analytiikkatoimintojaan rekrytoimalla lisää työntekijöitä metabolomiikkateknologian ja sen sovellusten metodologiseen kehittämiseen bio- ja lääketieteen eri alojen tutkimusprojekteissa. Avoimet tehtävät sijoittuvat teknillisen tiedekunnan, Turun Biotiedekeskuksen ja matemaattis-luonnontieteellisen tiedekunnan yhteistyöhankkeeseen. Tehtävien rahoitus pohjautuu Turun yliopiston strategiarahoitukseen ja ulkoisiin rahoituslähteisiin kuten Jane ja Aatos Erkko Säätiö, Suomen Akatemia, Juvenile Diabetes Research Foundation, Novo Nordisk Foundation ja EU-komissio. Tehtävien pääpaino on päivittäisessä toiminnassa liittyen metabolomiikan/lipidomiikan tutkimustoimintaan, menetelmien kehittämiseen sekä niiden soveltamiseen tutkimusprojekteissa keskittyen sekä ruokaan ja ravitsemukseen että tiettyihin lääketieteellisiin osa-alueisiin osana väitöskirjatyöntekijän/tutkijatohtorin projekteja. Tehtävät sijoittuvat tutkimusta johtavien Kati Hanhinevan, Matej Orešičin ja Alex Dickensin tutkimusryhmiin.

Lipidomiikan tutkimuksessa pääpaino on LC-MS-pohjaisten menetelmien jatkokehityksessä, käyttöönottamisessa ja soveltamisessa sisältäen sekä laaja-alaisen lipidiprofiloinnin että lipidirakenteiden tarkan analyysin kuten isomeerien identifikaation ja kvantitoinnin sekä kaksoissidosten paikan määrityksen lipidien asyyliketjuissa. Lisäksi keskitymme steroidianalytiikan kehittämiseen uuden, juuri hankinnassa olevan QqQ instrumentin avulla.

Erikoistutkijan/ tutkijatohtorin tehtävä

Päätehtävät ja vastuualueet

  • Päivittäiset toiminnot ja ongelmanratkaisu koskien metabolomiikka- ja lipidomiikkasovelluksissa käytettäviä LC-MS-instrumentteja, yhteistyössä palkattavan laboratorioinsinöörin/teknikon kanssa
  • Analyyttisten menetelmien kehittäminen MS-pohjaisiin analyyseihin kohdennetulle ja ei-kohdennetulle metabolomiikka/lidomiikkametodeille mukaan lukien yhdisteiden tunnistamisen
  • Dokumentaatio ja raportointi

Vaadittavat ominaisuudet

  • Soveltuva tohtorin tutkinto analyyttisestä kemiasta, metabolomiikasta tai muulta relevantilta alalta
  • Ensiluokkaiset taidot nestekromatografia-massaspektrometrilaitteiston käyttämiseen ja ongelmanratkaisuun
  • Kokemus metabolomiikan/lipidomiikan menetelmäkehittämisestä
  • Motivoitunut, oma-aloitteinen ja itsenäinen työskentelyote
  • Hyvä kirjallinen ja suullinen englannin kielen taito

Toivotut lisäominaisuudet

  • vahva kansainvälinen julkaisutausta
  • käytännön kokemus LC-MS ja LC-MS/MS ja/tai GC-MS/GC-MS-MS analytiikasta
  • aikaisempi kokemus lipidomiikka-analyyseistä ja ymmärrystä lipidien kemiasta ja biokemiasta
  • LC-MS analytiikkaan liittyvää ohjelmisto-osaamista kuten esim Topspin, Analyst, Compass , MassHunter, MS-DIAL, mzMine, MassLynx
  • selkeää näyttöä uusien teknologioiden implementaatiosta
  • kokemusta projektiraportoinnista ja/tai projektirahoitusten hakemisesta

Tutkijatohtori/Väitöskirjatyöntekijä

Päätehtävät ja vastuualueet

  • MS-pohjaisen metabolomiikka/lidomiikka-analytiikan soveltaminen tutkimusprojekteissa painottuen lääketieteeseen, ruokaan ja ravintoon
  • Erilaisten näytteiden tutkiminen, esim.  kasvi/ruokanäytteet, mikrobikannat ja ihmisperäiset näytteet
  • metabolomiikan data-analyysit ja niiden metodien kehittäminen
  • dokumentointi ja raportointi
Vaadittavat ominaisuudet
  • Soveltuva tohtorin/maisterintutkinto analyyttisestä kemiasta, elintarvikekemiasta, biokemiasta, metabolomiikasta tai muulta relevantilta alalta
  • Tavanomaisten bioanalyyttisten tutkimusmenetelmien tuntemus
  • Hyvät kommunikaatiotaidot
  • Hyvä kirjallinen ja suullinen englannin kielen taito

Toivotut lisäominaisuudet

  • kansainvälisiä julkaisuja
  • käytännön kokemus LC-MS ja LC-MS/MS ja/tai GC-MS/GC-MS-MS analytiikasta
  • aikaisempi kokemus lipidomiikka-analyyseistä ja ymmärrystä  kemiasta ja biokemiasta
  • LC-MS analytiikkaan liittyvää ohjelmisto-osaamista kuten esim Topspin, Analyst, Compass , MassHunter, MS-DIAL, mzMine, MassLynx
  • kokemusta projektiraportoinnista 

Laboratorioinsinööri/teknikko 

Päätehtävät ja vastuualueet

  • Päivittäiset toiminnot liittyen näytteiden ja ajoliuosten valmistamiseen ja instrumenteista huolehtimiseen
  • Kryogeenisten nesteiden täyttö NMR systeemeihin
  • Laboratoriotarvikkeiden tilaaminen
  • Näyte- ja kemikaalitietokantojen ylläpito

Vaadittavat ominaisuudet

  • tehtävään soveltuva tutkinto
  • 1-5 vuoden työkokemus
  • Hyvät tiimityötaidot
  • Hyvä suomen ja englannin kielten taito
  • Erinomaiset organisointitaidot

Toivotut lisäominaisuudet

  • Käyttökokemus MS/NMR laitteistoista ja kemiallisten rakenteiden analytiikasta
  • motivoitunut ja kiinnostunut asenne käytännön työhön high-end-instrumenttien kanssa
  • aiempi työkokemus biologisten näytteiden analysoinnin valmistelusta
  • LC-MS analytiikkaan liittyvää ohjelmisto-osaamista esim Topspin, Analyst, Compass , MassHunter, MS-DIAL, mzMine MassLynx
  • perus-GC ja/tai LC ylläpidon tuntemus

Palkkaus

Valintakriteerimme perustuvat siihen, että löydämme tehtävään pätevimmän ja sopivimman henkilön. Käytännössä se tarkoittaa, että huomioon otetaan paitsi koulutus, tieteelliset julkaisut ja työkokemus, myös henkilökohtaiset ominaisuudet, kommunikaatio- ja motivaatiotekijät sekä muut tehtävän hoitamisen kannalta olennaiset tekijät.

Palkka määräytyy yliopistojen työehtosopimuksen perusteella ja riippuu hakija koulutuksesta ja pätevyyksistä. Tehtävät sijoittuvat opetus- ja tutkimushenkilökuntaan, paitsi laboratorioinsinöörin/teknikon tehtävä kuuluu muuhun henkilökuntaan. Työsuhteeseen sisältyy mm. lakisääteiset eläke- ja työttömyysvakuutusmaksut, hyvät työterveys- ja liikuntapalvelut ja lomaraha.

Palkka laboratorio-insinöörille/teknikolle ja väitöskirjatyöntekijälle on keskimäärin 2300 -2700 eur/kk ja tutkijatohtorille keskimäärin 3100-3500 eur/kk. Erikoistutkijan palkka on pätevyydestä ja kokemuksesta riippuen keskimäärin 3400-4500 eur/kk.

Työsuhteen kesto

Tehtävien aloittamisajankohta on neuvoteltavissa, toivottavasti kuitenkin elo-syyskuussa 2021. Tehtävien kesto on 24 kuukautta, ja saattaa olla mahdollista että ne jatkuvat sen jälkeenkin. Tehtävissä on kuuden kuukauden koeaika ja niiden pätevyysvaatimukset löytyvät yliopiston johtosäännöstä: https://www.utu.fi/sites/default/files/public%3A//media/file/turun-yliopiston-johtosaanto.pdf

Hakemuksen lähettäminen

Lähetäthän englanninkielisen hakemuksesi mahdollisimman pian, kuitenkin viimeistään 31.5.2021 yliopiston sähköisen hakujärjestelmän kautta. Aloitamme hakemusten arvioinnin heti saapumisen jälkeen ja saatamme haastatella osaa ehdokkaista jo toukokuussa.

Linkki hakujärjestelmään löytyy yliopiston nettisivuilta 
https://www.utu.fi/fi/yliopisto/tule-meille-toihin/avoimet-tehtavat

Liitä englanninkieliseen hakemukseesi

  1. motivaatiokirje (max 1 sivu) joka keskittyy omiin vahvuuksiisi liittyen juuri meidän tutkimusaiheisiimme.
  2. ansioluettelo
  3. tutkintotodistuksen kopiot
  4. vähintään kolmen suosittelijan yhteystiedot (nimi, työpaikka, sähköpostiosoite)
  5. julkaisuluettelo jossa korostettuna viisi tehtävän kannalta olennaisinta julkaisua (ei vaadita laboratorioinsinöörin/teknikon tehtävässä)
  6. väitöskirjatyöntekijältä todistus riittävästä englannin kielen taidosta (https://www.utu.fi/en/research/utugs/how-to-apply/language )

Hakemisprosessiin liittyvissä kysymyksissä avustaa tarvittaessa henkilöstöasiantuntijamme Paula Luoma paula.luoma(at)utu.fi

Laajempia tietoja rekrytoivista yksiköistä ja niiden mielenkiintoisista tutkimuskohteista löydät englanninkielisestä ilmoituksesta: https://www.utu.fi/en/university/come-work-with-us/open-vacancies

Tutkimusryhmien johtajista löydät tietoa täältä

professori Matej Orešič: https://bioscience.fi/research/systems-medicine/profile/
apulaisprofessori Alex Dickens: https://www.utu.fi/en/people/alex-dickens
professori Kati Hanhineva: https://www.utu.fi/en/people/kati-hanhineva

He kertovat myös mielellään tehtävästä tarkemmin

matej.oresic(at)utu.fi
alex.dickens(at)utu.fi
kati.hanhineva(at)utu.fi

Toivotamme sinut sydämellisesti tervetulleeksi monikulttuuriseen työyhteisöömme.