Multiple postdoctoral fellow positions are available in the Dhvanit Shah Laboratory (www.shahlaboratory.org)
at the Center for Childhood Cancers and Blood Diseases, Nationwide
Children’s Hospital & Ohio State University, Columbus OH, United
States. The Shah laboratory provides a dynamic microenvironment that
offers excellent opportunities for intellectual exchange
and collaborations among investigators from diverse fields. We
investigate the origin, development, and differentiation of
hematopoietic stem cells (HSCs), and their utility in treating patients
with blood and bone marrow diseases. We have expertise in utilizing
zebrafish, mice, and human induced pluripotent stem (iPS) cells to
analyze novel genes and mechanisms important for blood formation. Our
goals are to utilize our knowledge in developing cellular- and
mechanism-based therapies as well as generating functional
HSCs for the treatment of hematological diseases.
Position # 1: Epigenetics of Hematopoietic Stem Cell Development and Disorders
The
ideal candidate will have Ph.D., M.D., or M.D./Ph.D. in Regenerative
Medicine, Stem Cells, Immunotherapy, Hematology, Oncology, and/or
Biology. This position offers
an excellent opportunity to learn and apply skills in epigenetics,
directed differentiation of human induced pluripotent stem cells
(iPSCs), HSC transplant, xenograft, computational biology,
high-throughput screening, gene-editing, and/or molecular and cellular
biology techniques.
Position # 2: Bioengineering of 4D or 3D Tissue Scaffold Development
The
ideal candidate will have Ph.D., M.D., or M.D./Ph.D. in Tissue
Engineering, Biomaterials, Biophysics, Machine Learning, Systems
Biology, Chemical Engineering, and/or
Drug Development. This position offers an excellent opportunity to
learn and apply skills in organoid development, 3D bio-printing,
Bio-MEMS, artificial intelligence, microfluidics, proteomics, and/or
medicinal chemistry.
Strong
background in one or more of these areas is preferred but not required.
Qualified candidate should be able to work independently as well as in a
group environment.
Interested candidates should send their cover letter, CV, and contact details of three references
The
Department of Clinical Pathology and Cytology in Solna is increasing
the use of NGS-based analysis. We are therefore looking for a new member
of the Clinical Molecular Pathology
lab in Solna with knowledge and experience in bioinformatics
(computational biologist). The job will focus on establishing and
conducting routine diagnostic analyses on clinical material. Tasks will
initially focus on analyzing genomic variants in a team setting,
but may be expanded to other NGS methods as well. There will be a close
collaboration with the Clinical Genomics part of SciLifelab. The job is
of indefinite duration (tillsvidareanställning), full time.
More information or have questions regarding this position, please contact the lab manager Semra Öz Baloglu semra.oz-baloglu@sll.se,
preferably within two weeks.
Significant experience / qualifications:
Practical experience of bioinformatics
General knowledge in bioinformatics
Good social skills
Proficient in English and at least intermediate in Swedish (oral and written)
Experience working with IGV (integrated genome viewer)
Some wet-lab experience, including DNA/RNA extraction and PCR
Biopankkien Osuuskunta Suomi – FINBB on kuuden suurimman sairaanhoitopiirin, kuuden yliopiston ja Suomen valtion (THL) omistama, vuonna 2017 perustettu yritys. Tavoitteenamme
on luoda Suomeen kansainvälisesti edistyksellinen
biopankki-infrastruktuuri biolääketieteellistä tutkimustoimintaa
tehostaen ja lisäten maassamme. Olemme ensimmäisenä Euroopassa
kehittäneet yhden luukun periaatteella toimivan Fingenious®
-digitaalisen kansallisen palveluportaalin, mikä on rakennettu
palvelemaan akateemisia ja yrityksissä työskenteleviä tutkijoita
maailmanlaajuisesti.
Kasvavanorganisaatiomme
tavoitteena on luoda Suomeen maailman paras biopankkiverkosto
hyvinvointia, terveyttä ja tutkimustoimeliaisuutta maassamme lisäten.
Tiimimme koostuu tällä hetkellä viidestä huippuammattilaisesta.
Olemme
nyt kehittymässä rakentamisvaiheesta kohti kaupallistamisvaihetta ja
vahvistamme organisaatiotamme uusilla avainhenkilöillä. Etsimme nyt
biolääketieteellistä markkinaa tuntevaa
ASIAKKUUS- JA PALVELUJOHTAJAA
Tulet vastaamaan asiakkuuksiemme johtamisesta ja koordinoimisesta sekä kansallisesti että kansainvälisesti. Kehität FINGENIOUS®
-brändin alla toimivia palveluita ja liiketoimintamalleja yhteistyössä
organisaatiomme kanssa ja identifioit myös uusia
liiketoimintamahdollisuuksia. Sinulla on myös tärkeä rooli palveluidemme
kaupallistamisessa ja hinnoittelukäytäntöjemme kehittäjänä.
Odotamme sinulta
akateemista loppututkintoa sekä kokemusta biolääketieteellisestä
tutkimuksesta ja sen organisoimisesta; kokemus biopankkitoiminnasta
ja/tai kansainvälisestä tutkimustoiminnasta on sinulle merkittävä
lisäetu. Kokemuksesi kautta ymmärrät hyvin sekä akateemisten että
yritysmaailman tutkijoiden tarpeita. Raportoit tehtävässäsi
toimitusjohtajalle.
Olet palveluliiketoiminnan ammattilainen ja toimit mielellään
asiakasrajapinnassa; olet persoonaltasi liiketoimintalähtöinen ja
tuloshakuinen. Olet työssäsi itseohjautuva ja yrittäjähenkinen ja
sovellut pieneen ja ketterään organisaatioomme. Olet hankkinut kokemusta
kansainvälisestä toiminnasta ja sinulla on erinomainen englannin kielen
taito; muu kielitaito on sinulle lisäetu. Olet valmis työssäsi myös
matkustamaan. Tehtävän sijoituspaikkana on joko Helsinki tai Turku.
Tarjoamme Sinulle mahdollisuutta
olla rakentamassa maailman parasta biopankkien verkostoa yhdessä
partnereidemme ja sitoutuneiden asiantuntijoidemme kanssa. Suomesta on
kehittynyt biopankkitutkimuksen globaali edelläkävijä ja pääset tekemään
merkityksellistä työtä, jolla on suuri vaikutus koko Suomen
terveydenhoidon ja yksilöllisen lääketieteen tulevaisuuteen.
Tehtävää koskeviin tiedusteluihin vastaa
Arespartnersin seniorikonsultti Erkki Levä puh. 040 181 9695. Lähetä
hakemuksesi ja CV:si palkkatoivomuksineen osoitteessa https://aresnets.arespartners.fi/27.1.2020 mennessä.
Biopankkien Osuuskunta Suomi – FINBB on kuuden suurimman sairaanhoitopiirin, kuuden yliopiston ja Suomen valtion (THL) omistama, vuonna 2017 perustettu yritys. Tavoitteenamme
on luoda Suomeen kansainvälisesti edistyksellinen
biopankki-infrastruktuuri biolääketieteellistä tutkimustoimintaa
tehostaen ja lisäten maassamme. Olemme ensimmäisenä Euroopassa
kehittäneet yhden luukun periaatteella toimivan Fingenious®
-digitaalisen kansallisen palveluportaalin, mikä on rakennettu
palvelemaan akateemisia ja yrityksissä työskenteleviä tutkijoita
maailmanlaajuisesti.
Kasvavan organisaatiomme tavoitteena on luoda
Suomeen maailman paras biopankkiverkosto hyvinvointia, terveyttä ja
tutkimustoimeliaisuutta maassamme lisäten. Tiimimme koostuu tällä
hetkellä viidestä huippuammattilaisesta.
Olemme nyt
kehittymässä rakentamisvaiheesta kohti kaupallistamisvaihetta ja
vahvistamme organisaatiotamme uusilla avainhenkilöillä. Etsimme nyt
TIEDE- JA VIESTINTÄPÄÄLLIKKÖÄ
Tulet vastaamaan
FINBB:n sekä jäsenbiopankkiemme biolääketieteellisiin projekteihin
liittyvästä viestinnästä sekä kansallisesti että kansainvälisesti.
Toimit FINBB:n lääketieteellisenä asiantuntijana sekä FINBB:n että
biopankkien edustajana eri kansallisissa tiedeprojekteissa ja
työryhmissä; olet myös yhteyshenkilömme eurooppalaiseen
biopankkiverkostoon. Olet keskeinen henkilö Suomen biopankkien verkoston
rakentamisessa maailmaan parhaaksi. Vastuualueisiisi kuuluu myös
lääketieteellisten tutkimussuunnitelmien laatiminen yhdessä
asiakkaidemme kanssa. Raportoit tehtävässäsi toimitusjohtajalle.
Odotamme sinulta
korkeakoulu- ja mieluiten tohtoritasoista tutkintoa luonnontieteiden
tai lääketieteen alalta; tunnet jo entuudestaan biolääketieteellistä
tutkimusta ja biopankkimaailmaa Suomessa ja Euroopassa. Kokemuksesi olet
hankkinut esim. tiedeviestinnästä vastaavana tai medical writer
-tyyppisistä tehtävistä.
Sinulla on erinomaiset kansainvälisen
tason kommunikointi- ja viestintätaidot ja edustat mielelläsi FINBB:tä
mm. eri tiedetapahtumissa Suomessa ja maailmalla. Olet työssäsi
itseohjautuva ja yrittäjähenkinen ja sovellut pieneen ja ketterään
organisaatioomme. Tehtävä edellyttää jonkin verran matkustamista sekä
Suomessa että ulkomailla. Tehtävän sijoituspaikkana on joko Helsinki tai
Turku.
Tarjoamme Sinulle mahdollisuutta olla
rakentamassa maailman parasta biopankkien verkostoa yhdessä
kumppaneidemme ja sitoutuneiden asiantuntijoidemme kanssa. Suomesta on
kehittynyt biopankkitutkimuksen globaali edelläkävijä ja pääset tekemään
merkityksellistä työtä, jolla on suuri vaikutus koko Suomen
terveydenhoidon ja yksilöllisen lääketieteen tulevaisuuteen.
Tehtävää koskeviin tiedusteluihin vastaa
Arespartnersin seniorikonsultti Erkki Levä puh. 040 181 9695. Lähetä
hakemuksesi ja CV:si palkkatoivomuksineen osoitteessa https://aresnets.arespartners.fi/27.1.2020 mennessä.
PhD positions are available at Nottingham Trent University. If you are interested in working on autotransporters or other bacterial cell surface components, please contact Jack C. Leo (jack.leo@ntu.ac.uk).
One postdoctoral fellow
position is immediately available in the Pan laboratory in Department of
Neurology and Molecular Pharmacology Program at Memorial
Sloan-Kettering Cancer Center. The research in Pan’s lab focuses
on molecular and cellular mechanisms of mu opioid actions using
state-of-the-art molecular, biochemical, chemical and pharmacological
approaches. providing the foundation of developing novel analgesic drugs
for pain treatment (see
Pharmacol Rev. 65:1257-1317, 2013; J Clin Invest. 125:2626-2630, 2015;
J Clin Invest, 127:1561-1573, 2017).
The applicant(s) will participate in one or two of the projects in the following areas:
1) Investigating the
mechanisms underlying alternative splicing of the mu opioid receptor
gene (OPRM1) and its relevance to opioid pharmacology;
2) Mapping and characterizing mu agonist-induced receptor-protein interactions that contribute to opioid actions;
3) Determining molecular mechanisms of mu opioid-induced tolerance, respiratory depression and reward; and
4) Defining molecular mechanism of the novel analgesic drugs.
The laboratory will also
provide a wealth of molecular, biochemical and pharmacological expertise
to facilitate both research and career development. Highly-motivated
candidates with experience in molecular biology
and biochemistry or behavioral pharmacology are encouraged to apply.
The positions are fully funded by the grants from NIDA. Salary will be
commensurate with qualifications, laboratory experience and
institutional guidelines.
Applicants
interested in the position should send their curriculum vitae, along
with contact information for three references, to Dr. Ying-Xian Pan (pany@mskcc.org).
You are warmly welcome to the Joint Meeting of the Finnish Connective Tissue and Cell Biology Societies, which will be held on Thursday 13th February 2020 in Biomedicum, Helsinki. Please see the attached poster for more information.
NOTE#1 We still have room for a few participants for the dinner! NOTE#2 The abstract submission is now closed. The selected speakers will be informed during next week.
Welcome!
The Finnish Society for Cell Biology The Finnish Connective Tissue Society
We are looking for a bioinformatician to look after our database
consisting of health, sample, human genome and microbiome data.The
position is made available in the Finnish Health in Teens (Fin-HIT)
group, which is responsible for conducting a prospective
study of 11000 children and their parents (http://www.finhit.fi/).
Fin-HIT is based at the Folkhälsan Research Center
(https://www.folkhalsan.fi/en/research/ ) which is a part of “Samfundet
Folkhälsan i svenska Finland rf”, and which collaborates closely with
the University of Helsinki in the Meilahti Campus area. We are
collaborating with top researchers and research institutes in the world
to improve health and well-being.
Job description
The primary responsibilities of the position include:
• Managing genomic data repositories of variant data (16S rDNA gene sequencing, metagenome sequencing and genotyping chip data)
• Pre-processing and quality control of sequencing variant and genotyping chip data
• Execution and development of bioinformatics pipelines in high performance computing environmentand data analysis
• Managing databases with questionnaire and registry data
• Support research projects by preparing and delivering datasets on time
• Evaluate new methods and solutions to manipulate sequencing data
efficiently in distributed computing environments with a focus on data
protection
• Ensure data security Qualification and experience
• Master’s degree in bioinformatics, computational biology, computer sciences, or equivalent
• Previous experience in database management or knowledge in SQL or any other relevant tools is preferred
• Capability to work effortlessly in Linux environment and at least intermediate programming skills
• Skills in statistical programs (R, SPSS) are required
• Solution-seeking, proactive and responsible way of working and keeping deadlines under pressure
• Previous experience with genomics data, data science or
distributed computing environments is appreciated but not required – yet
ability to learn new things quickly is essential
• Any experience in working with omics analysis (transcriptomics, proteomics, metabolomics) will be a plus.
• Experience working in public cloud environment is a plus
• Fluent in spoken and written English, our team is international so Finnish skills are not required
We are looking for a team player to support the multidisciplinary
research team. We offer a great opportunity to learn on genomics and
health sciences. We are a dynamic, vibrant and highly motivated team.
Our working culture is positive, flexible and encouraging.
Salary and contract
The Folkhälsan Research Center follows the collective agreement for
the private social service sector. The salary will be based on previous
qualifications, experience and performance in the position. A six-month
trial period will be applied. The position
is available immediately. The contract will be offered for two years,
and a possibility to pursue a PhD degree will be considered.
The application should include a cover letter, a CV, and contact
information of at least two referees. Please write your application in
English and send via email to Heli Viljakainen.
For further information contact group leader Docent Heli Viljakainen, heli.viljakainen(at)helsinki.fi or +358 50 4485660.
The deadline for application is January 20th, 2020.
In collaboration with the Nordic EMBL Partnership in Molecular Medicine and
Helsinki Institute for Information Technology HIIT,
FIMM announces the opening of the 2020 call for applications
for Doctoral Students in Molecular Medicine, Bioinformatics, and
Artificial Intelligence as
part of the FIMM-EMBL International PhD recruitment and training program.
In this program, outstanding doctoral students are recruited to
the institute-level rotation program where they will work with two to
three different research groups during a six to nine month period prior
to matching to a research group in which they remain
for their doctoral studies. The program provides an exciting
opportunity to explore different research areas and working environments
as well as to learn a variety of science and technologies, making
connections within and beyond the institute.
The detailed call announcement can be found on the FIMM Open Positions page.
The deadline for applications is 2 February 2020, and application instructions are available within the announcement.
You
will be part of multifaceted projects aimed at understanding the
genetics and epigenetics of osteosarcoma and stem cells; developing 3D
models for osteosarcoma in vitro diagnostics
and applications of biomaterials.
Experience with RNA sequencing, bioinformatics, biomaterials or tissue
engineering is an advantage. Strong motivation to learn new techniques
is necessary. The successful
applicant must hold a PhD and post-doctoral experience. A six-month
trial period will be effective in the beginning of a contract. In
addition to English language, a strong command of Finnish language both
spoken and written is required. The salary will be
in accordance with the University salary system.
Responsibilities include:
Designing and coordinating parallel research projects
Preparing grant applications
Hands-on supervision of students
Writing manuscripts
Administrative responsibilities
Initiating and coordinating international collaborations
The following documents must be attached to the application:
1) Motivation letter
2) CV, including publications, and the contact details of 2 – 3 referees
The position is for one year, with the possibility for extension. This
position will be filled as soon as the right person is found. Candidates
for the post are required to present their scientific work, experiences
and expectations from the future work during
the interview. Interviews will be held both in English and in Finnish.
For further information and application submission contact:
Bettina Mannerström, PhD, Adj. Professor, e-mail: bettina.mannerstrom@helsinki.fi
