Suomen Solubiologit ry

PhD Position in Evolutionary and Developmental Biology at University of Helsinki, Institute of Biotechnology (Finland)

16.3.2018 | Ajankohtaista

One PhD position is available at the Institute of Biotechnology, University of Helsinki, in the laboratory of Dr. Nicolas Di-Poi (http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/di-poi/). Our laboratory is studying the evolution and development (Evo-Devo) of craniofacial structures such as teeth and skull bones in non-classical reptile models. The extraordinary morphological, ecological, and regenerative diversity of reptiles makes them an excellent group to elucidate the developmental processes and pathways that promote lineage diversification and phenotypic variation at different taxonomic levels.

Our research projects include complementary state-of-the-art methods, including molecular embryology, geometric morphometrics, theoretical modeling, genetics, and phylogenomics, and they offer an interdisciplinary environment for research training (see e.g., Nature Communications 9:376 (2018), Science Advances 2:e1600708 (2016), Science 339:78-81 (2013), Nature 464:99-103 (2010)). The exact topic of the research project will be discussed in detail during interview.

The successful Doctoral candidate will have a genuine interest in multidisciplinary research and will hold an excellent Master Degree (or equivalent) in Biology with a specialization in Developmental and/or Evolutionary Biology. In addition, the doctoral candidate will have a strong potential for excellence in research in the above-mentioned research areas.

The Institute of Biotechnology (BI) at the University of Helsinki is an independent research institute with a mission to increase knowledge in biotechnology and integrative biology and use this for the benefit of society. BI has research programs in Molecular Cell Biology, Developmental Biology, Genome Biology, and Structural Biology & Biophysics. BI offers state-of-the-art facilities in imaging, model organisms, proteomics, genomics, bioinformatics, histology, and crystallography. For more information, visit the website: http://www.biocenter.helsinki.fi/bi.

To apply, please send (in a single pdf document) a cover letter describing your previous research and motivation, your detailed CV including a list of publications, as well as contact information for 2 references to Dr Nicolas Di-Poi (nicolas.di-poi@helsinki.fi). The position is expected to start in July 2018 (or as agreed with the selected candidate), and candidates will be considered until the position is filled. Application deadline 31.5.2018.

Computational Biologist Position in Biomedicum Functional Genomics Unit, University of Helsinki

14.3.2018 | Ajankohtaista

Computational Biologist Position in Biomedicum Functional Genomics Unit

Biomedicum Functional Genomics Unit (FuGU) is a core unit organization located in Biomedicum Helsinki with expertise in genome profiling and functional genomics technologies. FuGU provides academic and industrial clients access to a wide range of genomics and related computational data analysis services. The unit is one of the five Life Science Research Infrastructures in the HiLIFE Genome Analysis Infrastructure (HGI) platform and is also part of the Biocenter Finland Genome-Wide Methods network. The unit operates together with Oncogenomics research group at the Genome-Scale Biology Research Program, Research Programs Unit.

A Computational biologist position is immediately available in FuGU for up to three years until the end of 2020. The position gives you the opportunity to develop your skills in a wide range of areas of genomics and genome-wide biology. Your work will mainly focus on data pre-processing and analysis of next-generation sequencing and microarray data but will also involve development of customized data analysis services, management of FuGU IT infrastructure, implementation of quality assurance standards, participation in design of customer projects and teaching in Master’s program and Graduate school courses.

The candidate should ideally have an MSc or PhD in bioinformatics, computational biology, biostatistics or relevant fields. Previous experience with the analysis of next-generation sequencing data is required with proven competence in:

· Working in the Linux/UNIX environment (Essential)

· Working with R/RStudio (Essential)

· Background in DNA-seq and RNA-seq sequence alignment analysis (Essential)

· Good programming skills (Python, R) (Preferable)

· Basic knowledge of statistics (Preferable)

· Background in microarray data analysis (Preferable)

The candidate should also have excellent team working and communication skills. Successful implementation of your tasks will require ability to work independently and in a team of lab coordinator, research assistants and researchers. The position also requires active communication with other HiLIFE research infrastructures as well as customers coming from academia and industry.

The salary of a computational biologist will be based on levels 8-9 of the demands level chart for other personnel in the salary system of the Finnish universities. In addition, a salary component based on personal work performance will be paid.

To apply, please send covering letter, CV and names of two referees to Dr. Outi Monni, E-mail: outi.monni@helsinki.fi . The closing date of the application is Sunday March 25^th, 2018. The position is filled as soon as suitable candidate is found.

For more information on Biomedicum Functional Genomics Unit and our research, please visit www.helsinki.fi/fugu/ and https://www.helsinki.fi/en/researchgroups/oncogenomics/ .

Suomen Solubiologit ry:n Facebook-sivulla jo 200 tykkääjää

13.3.2018 | Ajankohtaista

Mahtavaa, Suomen Solubiologit ry:n Facebook-sivulla on jo 200 tykkääjää! Erityisen iloisia olemme siitä, että solu- ja molekyylibiologian sekä näitä lähellä olevien alojen avoinna olevien työpaikkojen mainostaminen koetaan saamamme palautteen perusteella erittäin hyödylliseksi. Hienoa on myös se, että meitä on myös pyydetty mainostamaan työpaikkoja. Seuraamme aktiivisesti ilmoituksia ja mainostamme niitä parhaamme mukaan, mutta koska paikkoja on paljon niin olemme hyvin kiitollisia jos myös meitä lähestytään ja autetaan.

Haluaisimmekin muistuttaa, että jos työpaikallasi/yliopistossasi/instituutiossasi on alan työpaikka tai esimerkiksi gradupaikka avoinna, niin mainostamme sitä mielellämme nettisivuillamme ja Facebookissa! Voit ottaa yhteyttä esimerkiksi jonkun hallituslaisemme kautta (Paikkakunnat ja sähköpostiosoitteet löytyvät nettisivuiltamme), laittamalla sähköpostia osoitteeseen suomensolubiologit@gmail.com tai vaikka Facebook-viestillä. Facebook-sivuillemme pääset tästä.

Projektitutkija (biolääketiede) – Itä-Suomen yliopisto, Kuopion kampus, lääketieteen laitos, biolääketieteen yksikkö

13.3.2018 | Ajankohtaista

Projektitutkija (biolääketiede), Itä-Suomen yliopisto, lääketieteen laitos, Kuopion kampus, biolääketieteen yksikkö

Projektitutkija (biolääketiede)

Itä-Suomen yliopisto on yksi Suomen suurimmista monialaisista tiedeyliopistoista. Tarjoamme opetusta lähes sadassa pääaineessa. Opiskelijoita on noin 15 500 ja työllistämme 2 600 henkilöä. Toimimme 1.8.2018 alkaen kahdella kampuksella Joensuussa ja Kuopiossa. Kansainvälisissä yliopistojen vertailuissa sijoitumme maailman parhaiden joukkoon.

Terveystieteiden tiedekunta toimii Itä-Suomen yliopiston Kuopion kampuksella. Tiedekunnassa koulutetaan lääkäreitä, hammaslääkäreitä, ravitsemusterapeutteja, farmaseutteja ja proviisoreja sekä muita keskeisiä asiantuntijoita terveydenhuollon eri aloille. Tiedekunta on hyvin tutkimusintensiivinen. Kansainvälisesti korkeatasoinen ja monitieteinen tutkimus kytkeytyy vahvasti yliopiston strategiassa tunnistettuihin tutkimusalueisiin. Tiedekunnassa on noin 2 500 perustutkinto-opiskelijaa ja noin 450 jatko-opiskelijaa. Henkilökuntaa tiedekunnassa on 680. http://www.uef.fi/fi/ttdk

Haettavana on

projektitutkijan tehtävä (biolääketiede), lääketieteen laitos, biolääketieteen yksikkö, Kuopion kampus

Biolääketieteen yksikössä tehtävä tutkimus painottuu merkittävien kansansairauksien, kuten Alzheimerin taudin, syövän sekä kardiovaskulaaristen ja metabolisten sairauksien, molekyylitason mekanismeihin; niiden merkitykseen sairauksien synnyssä, diagnostiikassa ja hoidossa. Lisäksi yksikössä on vahvaa osaamista biolaskennan, kromatiinitutkimuksen ja solukuvantamisen alueella. Lisätietoja tutkimusprofiilistamme löytyy verkkosivuiltamme (www.uef.fi/biomedicine/tutkimus).

Yksikössämme toimiva solu- ja kudoskuvantamisyksikkö hakee tiimiinsä motivoitunutta projektitutkijaa, jolla on erityistä kiinnostusta ja innostusta biologisiin kuvantamisteknikoihin sekä niiden kehittämiseen. Solu- ja kuvantamispalveluyksikkö tarjoaa käyttäjäkoulutusta ja tukea mm. solu- ja kudosnäytteiden valmistuksessa, kuvantamisessa sekä tulosten analysoinnissa. Tiimimme on erikoistunut elävien ja kiinnitettyjen solujen ja kudosten korkean erotuskyvyn kuvantamiseen sekä elävien solujen molekyylidynamiikkaan. Yksikössämme on kaksi käyttäjäystävällistä konfokaalimikroskooppia ja jatkossa suurikapasiteettisia elävien solujen seulontamenetelmiä. Lisäksi yksikköön kuuluu nykyaikaisilla laitteilla ja palveluilla varustettu histologian tutkimuslaboratorio.

Projektitutkijan keskeisiin työtehtäviin kuuluvat: Kuvantamispalveluiden käyttäjien henkilökohtainen käyttäjäkoulutus, avustaminen näytteiden valmistuksessa, kuvantamismenetelmien käytössä ja tulosten analysoinnissa sekä kuvantamislaitteiden ylläpito. Lisäksi projektitutkija on mukana kehittämässä ja optimoimassa kuvantamismenetelmiä, kuva-analyysejä sekä fluoresenssivärjäystekniikoita. Projektitutkijan odotetaan osallistuvan aktiivisesti myös kuvantamispalveluyksikön toiminnan kehittämiseen. Tehtävään valittava osallistuu myös biolääketieteen alan opetukseen asiantuntijuutensa ja osaamisprofiilinsa mukaisesti.

Odotamme, että sinulla on vähintään maisterin tutkinto biologisen kuvantamisen, solubiologian, biokemian tai muulta soveltuvalta alalta. Aiempi kokemus fluoresenssi- ja immunofluoresenssisovelluksista, kuvantamisohjelmistoista ja kuvankäsittelystä katsotaan eduksi. Toivomme, että olet oma-aloitteinen, organisointi- ja yhteistyökykyinen sekä kykenet itsenäiseen työhön. Tehtävä edellyttää erinomaisia teknisiä ja tietoteknisiä taitoja. Hyvä suullinen ja kirjallinen englanninkielen taito on välttämätön edellytys työskennellessäsi kansainvälisessä työyhteisössämme.

Hakijoiden ansioita arvioitaessa huomioidaan hakijan tutkimuskokemus, kokemus kuvantamistekniikoista sekä alaan liittyvä tutkimuskokemus. Lisäksi huomioidaan opetuskokemus ja pedagoginen koulutus.

Projektitutkijan tehtävä täytetään ajalle 1.6.2018 – 31.12.2019. Määräaikaisuuden perusteena on projektiluonteinen työ: solukuvantamisyksikön toiminnan käynnistäminen ja kehittäminen.

Tehtävän palkkaus määräytyy yliopistojen opetus- ja tutkimushenkilöstön palkkausjärjestelmän vaativuustasolle 4-5 (2 475,31 – 2 865,30 €/kk). Tehtäväkohtaisen palkanosan lisäksi maksetaan henkilökohtaiseen suoriutumiseen perustuvaa palkanosaa, joka on enintään 46,3 % tehtäväkohtaisesta palkanosasta.

Uuden työntekijän tullessa yliopiston palvelukseen käytetään koeaikaa.

Lisätietoja: akatemiatutkija Kirsi Rilla, 040 355 3218, kirsi.rilla@uef.fi, yliopistotutkija Kirsi Ketola, 050 329 9984, kirsi.ketola@uef.fi, professori Mikko Hiltunen, 040 355 2014, mikko.hiltunen@uef.fi ja hakumenettelyn osalta henkilöstösihteeri Eleonora Tikkanen, 040 – 355 3082, eleonora.tikkanen@uef.fi.

Sähköiseen hakemukseen tulee liittää:
– ansioluettelo
– julkaisuluettelo
– kopiot tutkintotodistuksista ja kielitaitoa osoittavista todistuksista, ellei kielitaito ilmene tutkintotodistuksista
– motivaatiokirje
– lyhyt yhteenveto tutkimusprojekteista, joissa olet ollut mukana ja kuvaus roolistasi niissä. Yhteenvedon tulee sisältää myös kuvaus osaamisestasi biologisten kuvantamismenetelmien osalta.

Hakemus tulee jättää viimeistään 30.3.2018 sähköisellä hakulomakkeella.

Uusien hallituslaisten esittely: Emilia Kettunen

12.3.2018 | Ajankohtaista

Toinen uusi Suomen Solubiologit ry:n hallituksen jäsen on tällä hetkellä Jyväskylässä projektitutkijana työskentelevä Emilia Kettunen:

”Moikka! Valmistuin vastikään Jyväskylän yliopistosta filosofian maisteriksi pääaineenani solu- ja molekyylibiologia, ja siinä sivussa ehdin tutustua myös farmasian ja ravitsemustieteen opintoihin. Työskentelen tällä hetkellä projektitutkijana Jyväskylän yliopiston Liikuntatieteellisessä tiedekunnassa. Olen uusi Suomen Solubiologit ry:n hallituksen jäsen, mutta olen kuitenkin tätä ennen ollut aktiivisesti mukana SSB ry:n järjestämissä tapahtumissa. Suosittelen kaikkia SSB ry:n toiminnasta kiinnostuneita sekä solu- ja molekyylibiologihenkisiä osallistumaan mukaan toimintaan!”

Lämpimästi tervetuloa hallitukseen, Emilia!

Open postdoctoral position at the Karolinska Institutet, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Division of Genome Biology

12.3.2018 | Ajankohtaista

The “Cancer Therapy” group at the Karolinska Institutet – SciLifeLab, led by Oscar Fernandez-Capetillo is now looking for one postdoctoral scientist to join the group. Based on our prior experience, our research focuses on phenotypic screenings aiming to find genes or chemicals that can be of help in fighting against age-related diseases currently lacking a cure. For further information visit http://ki.se/en/mbb/oscar-fernandez-capetillo-group

Duties
We are seeking a highly motivated candidate with a recent Ph.D. in Cell Biology, Molecular Biology, Biochemistry or other relevant fields, with strong molecular biology skills. Experience in high-throughput imaging and screenings is not mandatory but would be a plus. Complete fluency in both written and spoken English is a request. The candidate’s communication and personal skills will be highly valued.

Entry requirements
A person is eligible for a position as Postdoctoral Researcher if he or she has obtained a PhD no more than seven years before the last date of employment as postdoc.

More information and application at https://ki.mynetworkglobal.com/se/what:job/jobID:197168/type:job/where:4/apply:1

Deadline for applications is March 15, 2018.

Muistutus Facebok-kyselystä

7.3.2018 | Ajankohtaista

Muistuttaisimme vielä Facebook-sivuillamme olevasta kyselystä, jonka avulla selvittelemme kiinnostavia teemoja seuraavalle seminaarillemme. Kysely on kiinnitetty sivumme alkuun joten sen pitäisi löytyä helposti. Vastausaikaa on vielä noin vuorokausi, joten käythän vastaamassa jos et ole sitä vielä tehnyt! Voit myös jakaa kyselyn ja vinkata siitä kaverille, jota yhdistyksemme toiminta voisi kiinnostaa!

Klikkaa itsesi tästä Suomen Solubiologit ry:n Facebook-sivuille!

Uusien hallituslaisten esittely: Eveliina Korhonen

7.3.2018 | Ajankohtaista

Aloitamme uusien hallituslaisten esittelyn Eveliina Korhosesta, joka toimii nuorempana tutkijana Itä-Suomen yliopiston Kuopion kampuksella:

”Tervehdys! Työskentelen tällä hetkellä nuorempana tutkijana Itä-Suomen yliopiston terveystieteiden tiedekunnassa Immuno-ophthalmology -tutkimusryhmässä. Väitöskirjassani tutkin inflammasomien toimintamekanismeja silmän sarveiskalvon ja verkkokalvon epiteelisoluissa. Tutkimus on perustutkimusta immunologian alalta, jossa solu- ja molekyylibiologian menetelmiä käytetään monipuolisesti tutkimuksen työkaluina. Itä-Suomen yliopistossa suoritettu FM-tutkinto biokemian alalta ja aikaisempi bioanalyytikon tutkinto ovat antaneet erinomaisen pohjan nykyiselle työlleni.

Minut tavoittaa helposti sähköpostin välityksellä (eveliina.korhonen@uef.fi) yhdistyksen toimintaan liittyvissä asioissa. Toivottavasti nähdään tulevissa SSB ry:n tapahtumissa!”

Mukavaa saada lisää edustusta Kuopiosta hallitukseemme, vielä kerran tervetuloa Eveliina!

Open positions in StatFinn

6.3.2018 | Ajankohtaista

StatFinn and EPID Research merged their operations in January 2017 and as one company offer a full range of services in Clinical Trial Biostatistics and Data Management, Epidemiology and Real- World Evidence that covers the drug development life cycle – from Phase I to Phase IV and beyond. Our clients are leading pharmaceutical and biotechnology companies worldwide.

We are offering an opportunity to work with innovative research organizations and latest healthcare trends in a dynamic and flexible environment of a growing expert company. If you are interested in drug development and healthcare business, this would be an ideal place for you.

More information and application at http://www.statfinn.fi/careers/

Open position for a postdoc or project researcher in the Computational Biomedicine group at the Bioinformatics Unit, Turku Centre for Biotechnology

6.3.2018 | Ajankohtaista

Come work with bioinformatics at Turku Centre for Biotechnology!

We are looking for a postdoc or project researcher as part of our multidisciplinary and international team of experts in the Computational Biomedicine group at the Bioinformatics Unit, Turku Centre for Biotechnology. There are also possibilities to work on projects suitable for a Master’s thesis.

The work involves processing and analysis of high-throughput next-generation sequencing data to answer complex biomedical questions. Specific focus areas include, for instance, epigenomics and non-coding RNA. In addition to method development, the work covers implementation and benchmarking of existing tools and workflows.

Turku Centre for Biotechnology (www.btk.fi) is a joint department of University of Turku (www.utu.fi) and Åbo Akademi University, providing high-end technologies and expertise to academic and industrial researchers and a stimulating multidisciplinary and international research environment. The Bioinformatics Unit and the Computational Biomedicine Group of Dr. Laura Elo (www.btk.fi/research/research-groups/elo) develops computational data analysis tools and mathematical models for biomedical research, with the eventual goal of improving the diagnosis, prognosis and treatment of complex diseases, such as diabetes, cardiovascular diseases and cancer. A specific focus is on analysing and interpreting data generated by modern high-throughput biotechnologies, such as deep sequencing and mass-spectrometry proteomics.

Qualifications

Suitable candidate should have knowledge of bioinformatics, statistics and R, Matlab or other mathematical/statistical software. She/he should have high level of motivation, self-initiative and independency. We appreciate good team work and communication skills in English (both oral and written). The project grant is for 1-2 years. Starting date is negotiable.

Application

Please send your application as one PDF document to bioinformatics-coordinator@utu.fi. The application should include a motivation letter, CV, contact information for 2-3 referees, and copies of relevant degree certificates. The position is open until suitable candidate is found.

For further information please contact bioinformatics-coordinator@utu.fi or +358 (0)29 4503796.